Seminar-Reihe zur Bildanalyse am MTZ

Seit November 2015 gibt es im MTZ eine neue Seminarreihe rund um die Bildanalyse mikroskopischer Aufnahmen. Das Ziel dieser Seminare ist es, Leute im Bereich der Bildanalyse näher zusammenzubringen, um Neues zu Lernen und schwierige Themen gemeinsam zu diskutieren.

Ziel

Wir sprechen über verschiedene Bildverarbeitungfragestellungen und diskutieren die Lösung solcher unter Verwendung unterschiedlicher Software.

Das Seminar ist offen für alle.... Anregungen und neue Fragestellungen sind willkommen und können unter an uns gesendet werden...

Ablauf

In den ersten beiden Seminaren wurden verschiedene Fragestellungen, die bei der Auswertung der mikroskopischen Aufnahmen auftreten, in kurzen Vorträgen vorgestellt und eine Liste interessanter Themen und offener Fragen/Probleme aufgestellt.
Das dritte Seminar war ein "Grundlagen"-Seminar, in dem von Herrn Dr. Peter Dieterich die grundlegenden Abläufe und Hintergründe bei der digitalen Bildverarbeitung vorgstellt wurden. Wichtige Filter wurden ebenfalls kurz erläutert.
Die Software Voloom wurde von Herrn Keil von microDimensions vorgestellt.
In den folgenden Seminaren sind Schwerpunkte wie Segmentierung (mit Arivis, Fiji und Imaris), Kolokalisation, Zellverfolgung ... geplant. Die genauen Details finden Sie weiter unten.

Wann?

monatlich donnerstags von 13 bis 15 Uhr

Programm

Die Seminare werden ausschließlich in englischer Sprache gehalten.

2019-09-26 | Dr. Michael Gerlach: "Basics of Image Processing in Imagej/FIJI"
2019-03-21 | Friederike Kessel (AG Hugo): "FACS on a slide – automatic analysis of fluorescent and histochemical tissue sections"
2019-02-28 | Dr. Michael Gerlach: "Preparing Images for Presentation - Do's and Dont's"

Frühere Verantstaltungen

2017

2017-11-02 | New round of "Kick off" seminars
2017-09-07 | Friederike Kessel (AG Hugo) "Kidney FACS on a slide - automatic quantification of Zeiss slidescanner data in FIJI and R "
2017-08-03 | Summer break
2017-07-06 | Robert Haase (MPI-CBG) "Deconvolution using Hygens"
2017-06-01 | Cancelled
2017-05-04 | Thomas Brock (AG Breier) "Cell microscopy and analysis" and Pallavi Subramanian (AG Chavakis) "How to analyze the rate of lipd droplet fisio in Imaris orn Arivis
2017-01-12 | Automated quantification of large volumes of slidescanner data (Dr. Michael Gerlach - AG Hugo)

2015 / 2016

2016-10-06 | 3D Visualization & Rendering in Arivis (Gunar Fabig - CFCI)
2016-09-01 | 3D Visualization & Rendering in Imaris (Dr. Michael Gerlach - AG Hugo)
2016-06-02 | Segmentation filter in Fiji (Dr. Robert Haase - MPI-CBG) starts at 15:30pm, room A.10.008 libary institute for physiological chemistry
2016-05-26 | Segmentation filter in Imaris (Dr. Michael Mahlert - Bitplane / Imaris)
2016-05-12 | Segmentation filter in Arivis (Dr. Maria Marosvölgyi - Arivis)
2016-04-07 | Basics for image analysis (Dr. Peter Dieterich - Institute for Physiology)
2016-03-03 | Introduction to Voloom Software by Mr. Keil from microDimensions more...
2016-02-11 | Cancelled
2015-12-03 | 2nd "kick off" seminar & brainstorming topics (5-6 speaker)
2015-11-05 | Intro & 1st "kick off" seminar (5-6 speaker)

Jeder Interessierte ist willkommen!

Ort

MTZ (H91), erste Etage, Raum D.10.016 (Lageplan UKD)

Wegbeschreibung

Nutzen Sie den Eingang an der Fiedlerstraße 42.
Gehen Sie zum Fahrstuhl auf der linken Seite und fahren Sie in die erste Etage.
Anschließend gehen Sie links durch die offene Glastür und direkt dahinter nach rechts.
Der Raum D.10.016 ist der erste Raum auf der rechten Seite.