Publications of the Plant Genomics Group

Cover-Abbildungen

Cover unseres Protokollbuches "Plant Cytogenetics and Cytogenomics" in der "Methods in Molecular Biology" Serie. Mehr erfahren

Cover zu unserem Artikel über Cassandra-Retrotransposons: Dies sind transponible Elemente, welche die Promoter-Struktur der 5S-rDNA eingefangen haben und mitnutzen. Mehr erfahren

Cover zu unserem Artikel zur Herkunft des Safran-Krokus.

Cover zu unserem Artikel zur genetischen Herkunft des Safran-Krokus. Mehr erfahren

Preprints und akzeptierte Artikel

A. El-nagish, S. Liedtke, S. Breitenbach and T. Heitkam (2024): "Preparing high-quality chromosome spreads from Crocus species for karyotyping and FISH", bioRxiv, doi: 10.1101/2024.11.18.624136. read preprint

N. Schmidt, S. Maiwald, L. Mann, B. Weber, K. M. Seibt, S. Breitenbach, S. Liedtke, G. Menzel, B. Weisshaar, D. Holtgräwe, T. Heitkam (2024): “BeetRepeats: reference sequences for genome and polymorphism annotation in sugar beet and wild relatives”, in press at BMC Research Notes , doi: 10.1186/s13104-024-06993-4.
The database of beet repeat sequences can be already accessed via Zenodo: 10.5281/zenodo.8255813.

S. Ishiguro, S. Taniguchi, N. Schmidt, M. Jost, S. Wanke, T. Heitkam, N. Ohmido (2024): "Repeatome landscapes and cytogenetics of hortensias provide a framework to trace Hydrangea evolution and domestication", in press at Annals of Botany.
Read the corresponding preprint: bioRxiv, doi: 10.1101/2024.06.05.597687.

Sielemann K., Schmidt N., Guzik J., Kalina N., Pucker B., Viehöver P., Breitenbach S., Weisshaar B., Heitkam T.and Holtgräwe D. (2023): "Pangenome of cultivated beet and crop wild relatives reveals parental relationships of a tetraploid wild beet", bioRxiv, doi: 10.1101/2023.06.28.546919.

Publikationen

37 Einträge

2020

Divergence of 3' ends as a driver of short interspersed nuclear element (SINE) evolution in the SalicaceaeKögler, A., Seibt, K. M., Heitkam, T., Morgenstern, K., Reiche, B., Brückner, M., Wolf, H. & 2 weitere, Juli 2020, in: The plant journal. 103, 1, S. 443-458, 16 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Satellite DNA landscapes after allotetraploidization of quinoa (Chenopodium quinoa) reveal unique A and B subgenomesHeitkam, T., Weber, B., Walter, I., Liedtke, S., Ost, C. & Schmidt, T., Juli 2020, in: The plant journal. 103, 1, S. 32-52, 21 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Bioinformatic and Molecular Analysis of Satellite Repeat Diversity in Vaccinium GenomesSultana, N., Menzel, G., Heitkam, T., Kojima, K. K., Bao, W. & Serçe, S., 9 Mai 2020, in: Genes. 11, 5Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
The conserved 3' Angio-domain defines a superfamily of short interspersed nuclear elements (SINEs) in higher plantsSeibt, K. M., Schmidt, T. & Heitkam, T., Feb. 2020, in: The plant journal. 101, 3, S. 681-699, 19 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Balancing Retrospection and Visions: The Cytogenetics Group of the Society of Plant Breeding (GPZ) Came Together in DresdenHeitkam, T., 14 Jan. 2020, in: Cytogenetic and genome research. 159, 4, S. 163-168, 6 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2019

Satellite DNA landscapes after allotetraploidisation of quinoa (Chenopodium quinoa) reveal unique A and B subgenomesHeitkam, T., Weber, B., Walter, I., Ost, C. & Schmidt, T., 23 Sept. 2019, in: The Plant JournalElektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Adding color to a century-old enigma: multi-color chromosome identification unravels the autotriploid nature of saffron (Crocus sativus) as a hybrid of wild Crocus cartwrightianus cytotypesSchmidt, T., Heitkam, T., Liedtke, S., Schubert, V. & Menzel, G., Juni 2019, in: New Phytologist. 222, 4, S. 1965-1980, 16 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2018

FlexiDot: highly customizable, ambiguity-aware dotplots for visual sequence analyses: FlexiDot: highly customizable, ambiguity-aware dotplots for visual sequence analysesSeibt, K. M., Schmidt, T. & Heitkam, T., 15 Okt. 2018, in: Bioinformatics. 34, 20, S. 3575-3577, 3 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2015

Next-generation sequencing reveals differentially amplified tandem repeats as a major genome component of Northern Europe's oldest Camellia japonicaHeitkam, T., Petrasch, S., Zakrzewski, F., Kögler, A., Wenke, T., Wanke, S. & Schmidt, T., Dez. 2015, in: Chromosome Research. 23, 4, S. 791-806, 16 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2014

The diversification and activity of hAT transposons in Musa genomesMenzel, G., Heitkam, T., Seibt, K. M., Nouroz, F., Müller-Stoermer, M., Heslop-Harrison, J. S. & Schmidt, T., Dez. 2014, in: Chromosome Research. 22, 4, S. 559-71, 13 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel