Publications of the Plant Genomics Group

Cover-Abbildungen

Cover unseres Protokollbuches "Plant Cytogenetics and Cytogenomics" in der "Methods in Molecular Biology" Serie. Mehr erfahren

Cover zu unserem Artikel über Cassandra-Retrotransposons: Dies sind transponible Elemente, welche die Promoter-Struktur der 5S-rDNA eingefangen haben und mitnutzen. Mehr erfahren

Cover zu unserem Artikel zur Herkunft des Safran-Krokus.

Cover zu unserem Artikel zur genetischen Herkunft des Safran-Krokus. Mehr erfahren

Preprints and accepted articles

W. Kim, N. Schmidt, M. Jost, E. M. Mkala, S. Winkler, G.-W. Hu, T. Heitkam and S. Wanke (2024): "Diverging repeatomes in holoparasitic Hydnoraceae uncover a playground of genome evolution", bioRxiv, doi: 10.1101/2024.12.09.626742.

Sielemann K., Schmidt N., Guzik J., Kalina N., Pucker B., Viehöver P., Breitenbach S., Weisshaar B., Heitkam T.and Holtgräwe D. (2023): "Pangenome of cultivated beet and crop wild relatives reveals parental relationships of a tetraploid wild beet", bioRxiv, doi: 10.1101/2023.06.28.546919.

Publikationen

40 Einträge

2018

FlexiDot: highly customizable, ambiguity-aware dotplots for visual sequence analyses: FlexiDot: highly customizable, ambiguity-aware dotplots for visual sequence analysesSeibt, K. M., Schmidt, T. & Heitkam, T., 15 Okt. 2018, in: Bioinformatics. 34, 20, S. 3575-3577, 3 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2015

Next-generation sequencing reveals differentially amplified tandem repeats as a major genome component of Northern Europe's oldest Camellia japonicaHeitkam, T., Petrasch, S., Zakrzewski, F., Kögler, A., Wenke, T., Wanke, S. & Schmidt, T., Dez. 2015, in: Chromosome Research. 23, 4, S. 791-806, 16 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2014

The diversification and activity of hAT transposons in Musa genomesMenzel, G., Heitkam, T., Seibt, K. M., Nouroz, F., Müller-Stoermer, M., Heslop-Harrison, J. S. & Schmidt, T., Dez. 2014, in: Chromosome Research. 22, 4, S. 559-71, 13 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
TE-Tracker: systematic identification of transposition events through whole-genome resequencingGilly, A., Etcheverry, M., Madoui, M., Guy, J., Quadrana, L., Alberti, A., Martin, A. & 7 weitere, 19 Nov. 2014, in: BMC bioinformatics. 15, S. 377Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Profiling of extensively diversified plant LINEs reveals distinct plant-specific subcladesHeitkam, T., Holtgräwe, D., Dohm, J. C., Minoche, A. E., Himmelbauer, H., Weisshaar, B. & Schmidt, T., Aug. 2014, in: The plant journal. 79, 3, S. 385-97, 13 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2013

Highly diverse chromoviruses of Beta vulgaris are classified by chromodomains and chromosomal integrationWeber, B., Heitkam, T., Holtgräwe, D., Weisshaar, B., Minoche, A. E., Dohm, J. C., Himmelbauer, H. & 1 weitere, 1 März 2013, in: Mobile DNA. 4, 1, S. 8Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2012

Evolutionary reshuffling in the Errantivirus lineage Elbe within the Beta vulgaris genomeWollrab, C., Heitkam, T., Holtgräwe, D., Weisshaar, B., Minoche, A. E., Dohm, J. C., Himmelbauer, H. & 1 weitere, Nov. 2012, in: The plant journal. 72, 4, S. 636-51, 16 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2011

Comparative physical mapping of rearranged and normal plant chromosomes by high-resolution FISH and megabase DNA techniquesSchmidt, T., Dechyeva, D., Fiege, C., Heitkam, T., Menzel, G., Weber, B., Wenke, T. & 1 weitere, 2011, Physical Mapping Technologies for the Identification and Characterization of Mutated Genes Contributing to Crop Quality. S. 9-15Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Buch/Konferenzbericht/Sammelband/Gutachten > Beitrag in Konferenzband

2010

The Ty1-copia families SALIRE and Cotzilla populating the Beta vulgaris genome show remarkable differences in abundance, chromosomal distribution, and ageWeber, B., Wenke, T., Frömmel, U., Schmidt, T. & Heitkam, T., Feb. 2010, in: Chromosome Research. 18, 2, S. 247-63, 17 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2009

BNR - a LINE family from Beta vulgaris - contains a RRM domain in open reading frame 1 and defines a L1 sub-clade present in diverse plant genomesHeitkam, T. & Schmidt, T., Sept. 2009, in: The plant journal. 59, 6, S. 872-82, 11 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel