Epigenetik als Modulator des Genoms
Da sie dem Organismus erlaubt, flexibel auf wechselnde Umwelteinflüsse zu reagieren, hat die Epigenetik in der Forschung enorm an Bedeutung gewonnen: Die Modifikation von einzelnen DNA-Basen und Histonen befähigt zu raschen und reversiblen Umweltanpassungen. In aktuellen Projekten untersuchen wir, welche Auswirkungen die DNA-Methylierung auf die Merkmals-Ausprägung von Organismen hat und ob sie auf die nächste Generation übertragen wird. Das Zusammenspiel verschiedener Sequenzierungstechnologien, molekularbiologischer und immunhistochemischer Methoden ermöglicht dabei einen tiefen Einblick in komplexe Vorgänge wie die Stilllegung verschiedener DNA Bereiche.
Chromosomale Lokalisation und DNA-Methylierung von Satelliten-DNAs auf Chromosomen der Zuckerrübe, detektiert mittels Fuoreszenz in situ Hybridisierung und Immunostaining (Weitfeld-Epifluoreszenz und strukturierte Beleuchtungsmikroskopie, Zakrzewski et al. 2014).
Ausgewählte Publikationen
- Kowar et al. (2016) Repeat composition of CenH3- chromatin and H3K9me2-marked heterochromatin in sugar beet (Beta vulgaris). BMC Plant Biology, 16:120 read article
- Schmidt et al. (2014) Cytosine methylation of an ancient satellite family in the wild beet Beta procumbens. Cytogenetic and Genome Research, 143:1-3, read article
- Zakrzewski et al. (2014) The CHH motif in sugar beet satellite DNA: a modulator for cytosine methylation. The Plant Journal, 78:937-950 read article
- Zakrzewski et al. (2011) Epigenetic profiling of heterochromatic satellite DNA. Chromosoma, 120 (4):409-422 read article