Publications of the Plant Genomics Group

Cover-Abbildungen

Cover unseres Protokollbuches "Plant Cytogenetics and Cytogenomics" in der "Methods in Molecular Biology" Serie. Mehr erfahren

Cover zu unserem Artikel über Cassandra-Retrotransposons: Dies sind transponible Elemente, welche die Promoter-Struktur der 5S-rDNA eingefangen haben und mitnutzen. Mehr erfahren

Cover zu unserem Artikel zur Herkunft des Safran-Krokus.

Cover zu unserem Artikel zur genetischen Herkunft des Safran-Krokus. Mehr erfahren

Preprints und akzeptierte Artikel

A. El-nagish, S. Liedtke, S. Breitenbach and T. Heitkam (2024): "Preparing high-quality chromosome spreads from Crocus species for karyotyping and FISH", bioRxiv, doi: 10.1101/2024.11.18.624136. read preprint

N. Schmidt, S. Maiwald, L. Mann, B. Weber, K. M. Seibt, S. Breitenbach, S. Liedtke, G. Menzel, B. Weisshaar, D. Holtgräwe, T. Heitkam (2024): “BeetRepeats: reference sequences for genome and polymorphism annotation in sugar beet and wild relatives”, in press at BMC Research Notes , doi: 10.1186/s13104-024-06993-4.
The database of beet repeat sequences can be already accessed via Zenodo: 10.5281/zenodo.8255813.

S. Ishiguro, S. Taniguchi, N. Schmidt, M. Jost, S. Wanke, T. Heitkam, N. Ohmido (2024): "Repeatome landscapes and cytogenetics of hortensias provide a framework to trace Hydrangea evolution and domestication", in press at Annals of Botany.
Read the corresponding preprint: bioRxiv, doi: 10.1101/2024.06.05.597687.

Sielemann K., Schmidt N., Guzik J., Kalina N., Pucker B., Viehöver P., Breitenbach S., Weisshaar B., Heitkam T.and Holtgräwe D. (2023): "Pangenome of cultivated beet and crop wild relatives reveals parental relationships of a tetraploid wild beet", bioRxiv, doi: 10.1101/2023.06.28.546919.

Publikationen

37 Einträge

2014

TE-Tracker: systematic identification of transposition events through whole-genome resequencingGilly, A., Etcheverry, M., Madoui, M., Guy, J., Quadrana, L., Alberti, A., Martin, A. & 7 weitere, 19 Nov. 2014, in: BMC bioinformatics. 15, S. 377Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Profiling of extensively diversified plant LINEs reveals distinct plant-specific subcladesHeitkam, T., Holtgräwe, D., Dohm, J. C., Minoche, A. E., Himmelbauer, H., Weisshaar, B. & Schmidt, T., Aug. 2014, in: The plant journal. 79, 3, S. 385-97, 13 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2013

Highly diverse chromoviruses of Beta vulgaris are classified by chromodomains and chromosomal integrationWeber, B., Heitkam, T., Holtgräwe, D., Weisshaar, B., Minoche, A. E., Dohm, J. C., Himmelbauer, H. & 1 weitere, 1 März 2013, in: Mobile DNA. 4, 1, S. 8Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2012

Evolutionary reshuffling in the Errantivirus lineage Elbe within the Beta vulgaris genomeWollrab, C., Heitkam, T., Holtgräwe, D., Weisshaar, B., Minoche, A. E., Dohm, J. C., Himmelbauer, H. & 1 weitere, Nov. 2012, in: The plant journal. 72, 4, S. 636-51, 16 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2011

Comparative physical mapping of rearranged and normal plant chromosomes by high-resolution FISH and megabase DNA techniquesSchmidt, T., Dechyeva, D., Fiege, C., Heitkam, T., Menzel, G., Weber, B., Wenke, T. & 1 weitere, 2011, Physical Mapping Technologies for the Identification and Characterization of Mutated Genes Contributing to Crop Quality. S. 9-15Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Buch/Konferenzbericht/Sammelband/Gutachten > Beitrag in Konferenzband

2010

The Ty1-copia families SALIRE and Cotzilla populating the Beta vulgaris genome show remarkable differences in abundance, chromosomal distribution, and ageWeber, B., Wenke, T., Frömmel, U., Schmidt, T. & Heitkam, T., Feb. 2010, in: Chromosome Research. 18, 2, S. 247-63, 17 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2009

BNR - a LINE family from Beta vulgaris - contains a RRM domain in open reading frame 1 and defines a L1 sub-clade present in diverse plant genomesHeitkam, T. & Schmidt, T., Sept. 2009, in: The plant journal. 59, 6, S. 872-82, 11 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel