Publications of the Plant Genomics Group
Cover-Abbildungen
Preprints
N.-A. Ankrah, A. El-nagish, S. Breitenbach, A. Tetteh, T. Heitkam (2023): “Comparative cytogenetics of kenaf (Hibiscus cannabinus L.) breeding lines reveals chromosomal instability and variability”, bioRxiv, doi: 10.1101/2023.11.18.567672.
Sielemann K., Schmidt N., Guzik J., Kalina N., Pucker B., Viehöver P., Breitenbach S., Weisshaar B., Heitkam T. and Holtgräwe D. (2023): "Pangenome of cultivated beet and crop wild relatives reveals parental relationships of a tetraploid wild beet", bioRxiv, doi: 10.1101/2023.06.28.546919.
Akzeptierte Publikationen
S. Garcia, A. Kovarik, S. Maiwald, L. Mann, N. Schmidt, J. P. Pascual-Diaz, D. Vitales, B. Weber, T. Heitkam (2024): "The Dynamic Interplay between Ribosomal DNA and Transposable Elements: A Perspective from Genomics and Cytogenetics", Molecular Biology and Evolution, doi: 10.1093/molbev/msae025.
Publikationen
2022
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Ancient Artworks and Crocus Genetics Both Support Saffron's Origin in Early Greece , 25 Feb. 2022, in: Frontiers in plant science. 13, S. 834416, 834416Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Übersichtsartikel (Review)
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Complete pan-plastome sequences enable high resolution phylogenetic classification of sugar beet and closely related crop wild relatives , 10 Feb. 2022, in: BMC genomics. 23, 1, 17 S., 113Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
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ECCsplorer: a pipeline to detect extrachromosomal circular DNA (eccDNA) from next-generation sequencing data , 14 Jan. 2022, in: BMC bioinformatics. 23, 1, S. 23-40, 15 S., 40Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
2021
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Can we have it all?: Repurposing target capture for repeat genomics. A commentary on: 'Aiming off the target: recycling target capture sequencing reads for investigating repetitive DNA' , 9 Nov. 2021, in: Annals of Botany. 128, 7, S. iii-vElektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
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Broken, silent, and in hiding: tamed endogenous pararetroviruses escape elimination from the genome of sugar beet (Beta vulgaris) , 26 Aug. 2021, in: Annals of Botany. 128, 3, S. 281-299, 19 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
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TE Hub: a community-oriented space for sharing and connecting tools, data, resources, and methods for transposable element annotation , 21 Juni 2021, in: Mobile DNA. 12, 1, S. 16Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
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The Cassandra retrotransposon landscape in sugar beet (Beta vulgaris) and related Amaranthaceae: recombination and re-shuffling lead to a high structural variability , 1 Jan. 2021, in: Annals of Botany. 127, 1, S. 91-109, 19 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
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Comparative Repeat Profiling of Two Closely Related Conifers (Larix decidua and Larix kaempferi) Reveals High Genome Similarity With Only Few Fast-Evolving Satellite DNAs , 2021, in: Frontiers in genetics. 12, S. 683668Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
2020
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Divergence of 3' ends as a driver of short interspersed nuclear element (SINE) evolution in the Salicaceae , Juli 2020, in: The plant journal. 103, 1, S. 443-458, 16 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
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Satellite DNA landscapes after allotetraploidization of quinoa (Chenopodium quinoa) reveal unique A and B subgenomes , Juli 2020, in: The plant journal. 103, 1, S. 32-52, 21 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel