Bio-image analysis, biostatistics, programming and machine learning for computational biology: Dr. rer. medic. Robert Haase (#RH1)
Kurzbeschreibung
In dieser Vorlesungsreihe führen wir in gängige Konzepte der mikroskopischen Bilddatenanalyse und insbesondere in die Python-Programmierung, Biobildanalyse, Biostatistik und das Forschungsdatenmanagement ein. Gegen Ende des Semesters führen wir die Studierenden in moderne Konzepte der künstlichen Intelligenz ein. Dieses Jahr haben wir eine Vorlesung über die Verwendung von chatGPT für die Biobildanalyse durchgeführt.
Schlagworte
- Datenwissenschaft, Maschinelles Lernen
- Biobildanalyse
- chatGPT
© Anna Poetsch
© Robert Haase
Was macht das Schmuckstück besonders?
Unsere Vorlesungsreihen und die begleitenden Praktika zeichnen sich durch hochgradig interaktive Sitzungen und offen zugängliche Lehrmaterialien aus.
Die Studierenden lernen die Grundlagen in Vorlesungen, in die sich jeder in hohem Maße einbringt. Wir verwenden zum Beispiel farbige Haftnotizen, um während der Vorlesung Quizfragen und Umfragen durchzuführen. Ohne dieses visuelle Feedback des Publikums kommt der Dozent nicht weiter. Nach jeder Vorlesung können die Studierenden das gerade Gelernte auf ihren eigenen Laptops ausprobieren, so dass sie Skripte für die funktionale Datenanalyse mit nach Hause nehmen und später wiederverwenden können, z. B. wenn sie promovieren.
Die Lehrmaterialien sind frei zugänglich und führen die Studierenden in eine offene Wissenschaftskultur ein und erklären ihnen, warum offen zugängliche Materialien in der modernen Wissenschaft eine entscheidende Rolle spielen können. Die Folien und Übungsmaterialien stehen unter der CC-BY 4.0-Lizenz und enthalten eine Lektion über Open-Access-Lizenzen, die die Studierenden in dieses wichtige Konzept des Datenmanagements einführt. Die Studierenden können jederzeit auf das Online-Repository der Lehrmaterialien zurückgreifen, auch in Zukunft, wenn sie an anderen Orten promovieren und ihr Wissen über die Biobildanalyse auffrischen.
Da das Thema heutzutage für die Wissenschaftskultur sehr relevant ist, wurde der Vortrag über die Verwendung von chatGPT für die Biobildanalyse, der der erste Teil unserer Vortragsreihe am CMCB war, auf YouTube geteilt.
Die Lehrveranstaltung war eine Zusammenarbeit zwischen Dr. Anna Poetsch und Dr. Melissa Sanabria (beide Biotec / CMCB TU Dresden) und Dr. Allyson Ryan und Dr. Robert Haase (beide PoL/CMCB TU Dresden).
Weiterführende Links
Kontaktperson
Organisationseinheit
DFG-Exzellenzcluster "Physics of Life", Bio-image Analysis Technology Development Group
Größe der Lehrveranstaltung
31 bis 100 Studierende
Abstimmungskennung
#RH1