Die Forschung konzentriert sich auf die Physiologie und Biochemie von saprotrophen Großpilzen (Basidiomycota, Ascomycota) sowie auf biotechnologische Aspekte, die sich aus ihren Stoffwechselaktivitäten ergeben. Einen Schwerpunkt bilden oxyfunktionalisierende Enzyme und ihre Anwendung in der organischen Synthese.

Im Zentrum seht der Abbau von Totholz durch Pilze und ihre extrazellulären Biokatalysatoren (Peroxidasen, Peroxygenasen, Laccasen, Glycosid-Hydrolasen) in Waldökosystemen; eine wichtige Rolle spielt dabei die Analyse der funktionellen Biodiversität. Hinzu kommen molekulare Untersuchungen zu pilzlichen und bakteriellen Lebensgemeinschaften in Abhängigkeit von variierenden Umweltbedingungen sowie die Genomsequenzierung und -analyse von Pilzen.

Dieser Bereich befasst sich mit der Analyse von Elementen und Verbindungen in verschiedenen Umweltkompartimenten mit den Schwerpunkten Wasser und Boden.