Zellen und Viren
Die Plattform Zellen und Viren verwendet diverse Zell-Systeme, um gezielt genetische Veränderungen von Zellen mittels viraler Systeme umzusetzen und zu analysieren. Dies erfolgt unter anderem mittels rekombinanter Adeno-assoziierter Viren (AAVs) und Retroviren. Neben in vitro Anwendung werden diese auch für in vivo Applikationen genutzt. Damit kann die Expression eines bestimmten Gens, zum Beispiel Egfl7, modifiziert werden (Überexpression oder Knockout). Mittels AAV-induzierter Cre-Rekombinase Expression kann dies auch ein gewebespezifischer (beispielsweise Hippocampus) sowie Promotor-getriebener zelltypspezifischer Knockout sein. Zudem können über die Applikationen von AAVs und Retroviren in vivo gezielt Zellpopulationen verfolgt oder ein Axon Tracing durchgeführt werden.
Darüber hinaus werden adhärente Zellen, Neurosphären, Co-Kulturen und Suspensionskulturen für weiterführende downstream-Analysen genutzt. Hierbei finden Studien zu Zell-Zell Interaktionen, Zell-Adhäsions-Experimente, Analysen zur Migrations- und Invasionskapazität mittels Boyden-Kammern oder auch Proliferations-und Apoptose-Studien ihre Anwendung. Neben Basis-Zellkulturtechniken werden auch komplexe Kultivierungs-Systeme, wie zum Beispiel Slice Kulturen von murinen Gehirnen und Gehirnregionen (Hippocampus) verwendet.
Zudem können primäre Neurosphären kultiviert und analysiert werden. Hierfür werden auch Subpopulationen der neuralen Linie mittels Fluorescence-activated cell sorting (FACS) hochrein sortiert. Dies ermöglicht zum Beispiel die separate Kultvierung von neuralen Stammzellen und proliferierenden Vorläuferzellen, sodass der Einfluss auf einzelne Zellstadien untersucht werden kann. Diese sortierten Zellen stehen zudem für weitere downstream-Analysen, wie RNA-Sequenzierung zur Verfügung
Des Weiteren werden Zellen unterschiedlicher Kulturbedingungen oder primäres Gewebe mittels Durchflusszytometrie an dem BD FACSymphony™ A3 Cell Analyzer (FACS facility, MTZ) auf die Expression bestimmter Oberflächen-Moleküle untersucht. Dabei kommen vielfältige Panel unter Nutzung von bis zu 23 Markern für die unterschiedlichen Zelltypen (wie Immunzellen und deren Subpopulationen, oder Gliom-Zellen) zum Einsatz.