Kerndatensatz Mikrobiologie – Daten-Standard zur gemeinsamen universitätsme­dizinischen Nutzung von Daten

Die konsequente Umsetzung des Kerndatensatzes Mikrobiologie der Medizininformatik-Initiative (MII) bietet der Medizinischen Fakultät enorme Chancen für Forschung, Lehre, Profilbildung und Drittmittelakquise. Der Kerndatensatz definiert, welche mikrobiologischen Daten universitätsweit standardisiert vorgehalten werden sollen, einschließlich Laboruntersuchungen wie Kultur, Mikroskopie, Molekulardiagnostik, Serologie und Immunologie. Zusätzlich werden Eigenschaften von Mikroorganismen wie Erregernamen, Resistenzmechanismen und untersuchte Bioproben erfasst. Auch die MRGN-Klassifizierung des Robert Koch-Instituts kann über das Datenmodell abgebildet werden. Die Modellierung erfolgt interoperabel nach HL7 FHIR über ART-DECOR und Forge/Simplifier.net.

Am Standort Dresden wird der Kerndatensatz Mikrobiologie derzeit aktiv implementiert und für die Bereitstellung im lokalen Datenintegrationszentrum (DIZ) vorbereitet. Die Arbeiten erfolgen in enger interdisziplinärer Zusammenarbeit zwischen dem Zentrum für Medizinische Informatik (ZMI) und der klinischen Infektiologie.

Für die klinische Forschung bedeutet dies, dass standortübergreifende Studien möglich werden und Methoden sowie Auswertungsskripte einfach wiederverwendet werden können. Die digitale Standardisierung stärkt zudem das Profil der Universität als innovativer Standort der Universitätsmedizin und erleichtert die Anbindung an nationale Forschungsinfrastrukturen, darunter nicht nur die Medizininformatik-Initiative, sondern etwa auch das bundesweit agierende Netzwerk Universitätsmedizin (NUM), in dem die Hochschulmedizin Dresden mittlerweile an 20 Forschungsprojekten und Infrastrukturen partizipiert, oder die Nationale Forschungsdateninfrastruktur NFDI.

Aktuelle Anknüpfungen des Kerndatensatzes umfassen:

• Risk Principe (MII): Entwicklung eines Vorhersagemodells für Krankenhausinfektionen wie HOBSI (Hospital-Onset Bloodstream Infections).
• NUM Studiennetzwerk: Aufbau einer deutschlandweiten Infrastruktur für klinische und klinisch-epidemiologische Studien.
• NUM SNID – Fachnetzwerk Infektionen: Vernetzung von Expertise zur Prävention und Behandlung von Infektionskrankheiten.

Die Nutzung des MII-Kerndatensatzes ermöglicht eine nachhaltige, digitale und vernetzte Universitätsmedizin, die sowohl national als auch international sichtbar ist und Forschungskooperationen erleichtert.

Weitere Informationen:  

MII Kerndatensatz Mikrobiologie

RISK PRINCIPE – Medizininformatik-Use Case "RISK Prediction for Risk-stratified INfection Control and PrEvention" (BMFTR)

RISK PRINCIPE - RISK Prediction for Risk-stratified INfection Control and PrEvention (ZMI)

NUM-Studiennetzwerk - Studiennetzwerk des Netzwerk Universitätsmedizin mit integriertem Fachnetzwerk Infektionsmedizin (ZMI)

Gemeinsam gegen Infektionskrankheiten: Das Fachnetzwerk Infektionen wächst (NUM SN)