Melanommetasta­sen: Zwei neue Veröffentli­chungen

Im Rahmen des MelBrainSys-Projektes, ein vom BMBF gefördert e:Med-Juniorverbund, wurden durch die Arbeitsgruppe von PD Dr. Michael Seifert zwei neue bioinformatische Analysen veröffentlicht, die zu einer besseren Identifikation und Charakterisierung von molekularen Unterschieden zwischen patientenspezifischen intra- und extrakraniallen Melanommetastasepaaren beitragen.

Die erste Fachpublikation in Computational and Structural Biotechnology demonstriert, wie ein netzwerkbasierter Ansatz genutzt werden kann, um Einflüsse von patientenspezifischen Treibergenen auf andere Gene und Signalwege zu ermitteln. Dies hat es ermöglicht, heterogene Patienten in drei homogene Subgruppen einzugruppieren:

https://doi.org/10.1016/j.csbj.2024.02.013

Die zweite Fachpublikation in Acta Neuropathologica Communications zeigt, wie ein Hidden Markov Modell genutzt werden kann, um Veränderungen in der Genexpression zwischen patientenspezifischen intra- und extrakraniallen Melanommetastasepaaren zu detektieren. Dies erlaubte eine umfassende Charakterisierung von Gemeinsamkeiten und Unterschieden zwischen intra- und extrakraniallen Melanommetastasen auf Gen- und Signalwegsebene:

https://doi.org/10.1186/s40478-024-01764-5