Neue Veröffentli­chung in Cancers

Wissenschaftler vom IMB haben einen neuen Artikel zum Thema „Comparative Gene Expression Analysis Reveals Similarities and Differences of Chronic Myeloid Leukemia Phases“ in der Fachzeitschrift Cancers veröffentlicht. Die Erstautorin der Studie ist Annemarie Schwarz, die sich im Rahmen ihres Medizinstudiums für eine Doktorarbeit im Bereich der angewandten bioinformatischen Datenanalyse entschieden hat. Betreut wird sie dabei von den Co-Autoren Dr. Michael Seifert und Prof. Ingo Röder.

Wir haben eine bioinformatische Analyse von frei verfügbaren Genexpressionsdaten der verschiedenen Phasen der chronischen myeloischen Leukämie (CML) durchgeführt. Paarweise Vergleiche haben dabei eine Vielzahl an differentiell exprimierten Genen aufgedeckt, die eine charakteristische Expressionssignatur bilden, welche die CML-Phasen klar unterscheidet. Unsere Analyse legt daher nahe, dass man die phasenweise CML-Entwicklung eher als einen dreistufigen anstatt einen zweistufigen Prozess betrachten sollte. Weiterhin konnten auf Basis eines netzwerkbasierten Ansatzes potenzielle Hauptregulatoren mit phasenspezifischen Expressionsverhalten ermittelt werden. Darüber hinaus hat ein Vergleich zu therapieresistenten Patienten zur Identifikation einer charakteristischen Signalwegssignatur geführt, die in Verbindung mit einem nicht Ansprechen der Standardtherapie stehen könnte.

Link zur Publikation: https://www.mdpi.com/2072-6694/14/1/256