Automatische DNA-Sequenzierung [G14]

Leiterin:  Dr. Beatrice Weber
Skript:     Skript WS 2016/17

Inhalt:
Das Praktikum ermöglicht einen Einblick in den Prozess der automatischen DNA-Sequenzierung. Die Teilnehmer untersuchen pflanzliche DNA-Sequenzen aktueller Forschungsprojekte durch Anwendung der Kettenabbruchmethode nach Sanger. Hierbei werden zwei verschiedene Strategien verfolgt: Direkte Sequenzierung von kurzen Plasmid-Inserts mittels des Plasmid-spezifischen M13 Primers, und Sequenzierung langer BAC-Inserts mittels Sequenz-spezifischer Primer. Die Studenten üben den Umgang mit einem automatischen DNA-Sequenzierungsgerät und lernen die computerbasierte Analyse der resultierenden Sequenzen, sowie die Erzeugung Sequenz-spezifischer Primer kennen. Am Kursende werden die Ergebnisse in einem Seminar diskutiert.
Angewandte Methoden: Isolation von Plasmid-DNA, Endonuklease-vermittelte DNA-Restriktion, Gelelektrophorese, DNA-Markierung und PCR.