Publications of the Plant Genomics Group

Cover-Abbildungen

Cover unseres Protokollbuches "Plant Cytogenetics and Cytogenomics" in der "Methods in Molecular Biology" Serie. Mehr erfahren

Cover zu unserem Artikel über Cassandra-Retrotransposons: Dies sind transponible Elemente, welche die Promoter-Struktur der 5S-rDNA eingefangen haben und mitnutzen. Mehr erfahren

Cover zu unserem Artikel zur Herkunft des Safran-Krokus.

Cover zu unserem Artikel zur genetischen Herkunft des Safran-Krokus. Mehr erfahren

Preprints und akzeptierte Artikel

A. El-nagish, S. Liedtke, S. Breitenbach and T. Heitkam (2024): "Preparing high-quality chromosome spreads from Crocus species for karyotyping and FISH", bioRxiv, doi: 10.1101/2024.11.18.624136. read preprint

N. Schmidt, S. Maiwald, L. Mann, B. Weber, K. M. Seibt, S. Breitenbach, S. Liedtke, G. Menzel, B. Weisshaar, D. Holtgräwe, T. Heitkam (2024): “BeetRepeats: reference sequences for genome and polymorphism annotation in sugar beet and wild relatives”, in press at BMC Research Notes , doi: 10.1186/s13104-024-06993-4.
The database of beet repeat sequences can be already accessed via Zenodo: 10.5281/zenodo.8255813.

S. Ishiguro, S. Taniguchi, N. Schmidt, M. Jost, S. Wanke, T. Heitkam, N. Ohmido (2024): "Repeatome landscapes and cytogenetics of hortensias provide a framework to trace Hydrangea evolution and domestication", in press at Annals of Botany.
Read the corresponding preprint: bioRxiv, doi: 10.1101/2024.06.05.597687.

Sielemann K., Schmidt N., Guzik J., Kalina N., Pucker B., Viehöver P., Breitenbach S., Weisshaar B., Heitkam T.and Holtgräwe D. (2023): "Pangenome of cultivated beet and crop wild relatives reveals parental relationships of a tetraploid wild beet", bioRxiv, doi: 10.1101/2023.06.28.546919.

Publikationen

37 Einträge

2024

Comparative cytogenetics of kenaf (Hibiscus cannabinus L.) breeding lines reveal chromosomal variability and instabilityAnkrah, N., El-nagish, A., Breitenbach, S., Tetteh, A. Y. & Heitkam, T., 12 Sept. 2024, in: Genetic resources and crop evolution. (2024), 14 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
The Dynamic Interplay between Ribosomal DNA and Transposable Elements: A Perspective from Genomics and CytogeneticsGarcia, S., Kovarik, A., Maiwald, S., Mann, L., Schmidt, N., Pascual-Díaz, J. P., Vitales, D. & 2 weitere, 2 Feb. 2024, in: Molecular Biology and Evolution. 41, 3, msae025Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Evolving together: Cassandra retrotransposons gradually mirror promoter mutations of the 5S rRNA genesMaiwald, S., Mann, L., Garcia, S. & Heitkam, T., 1 Feb. 2024, in: Molecular Biology and Evolution. 41, 2, msae010Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
High-fidelity (repeat) consensus sequences from short reads using combined read clustering and assemblyMann, L., Balasch, K., Schmidt, N. & Heitkam, T., 24 Jan. 2024, in: BMC Genomics. 25, 1, 109Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2023

Repeat turnover meets stable chromosomes: repetitive DNA sequences mark speciation and gene pool boundaries in sugar beet and wild beetsSchmidt, N., Sielemann, K., Breitenbach, S., Fuchs, J., Pucker, B., Weisshaar, B., Holtgräwe, D. & 1 weitere, 21 Dez. 2023, in: The Plant Journal. 118, 1, 20 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Die Rückkehr der Ringe: Sequenzierung extrachromosomaler zirkulärer DNAsMann, L. & Heitkam, T., Sept. 2023, in: Biospektrum. 29, 5, S. 475-478, 4 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel
Preparation of Mitotic Chromosomes with the Dropping TechniqueSchmidt, N., Weber, B., Klekar, J., Liedtke, S., Breitenbach, S. & Heitkam, T., 20 Juni 2023, Plant Cytogenetics and Cytogenomics : Methods and Protocols. Heitkam, T. & Garcia, S. (Hrsg.). Humana Press, S. 151-162, 12 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Buch/Konferenzbericht/Sammelband/Gutachten > Beitrag in Buch/Sammelband/Gutachten
Plant Cytogenetics and Cytogenomics: Methods and ProtocolsHeitkam, T. & Garcia, S., 2 Juni 2023, New York: Humana Press, 564 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Buch/Gutachten/Sammelbände > Sammelband
How to start a LINE : 5’ switching rejuvenates LINE retrotransposons in tobacco and related Nicotiana speciesHartig, N., Seibt, K. M. & Heitkam, T., 25 März 2023, in: The Plant Journal. 115, 1, S. 52-67, 16 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Fachzeitschrift > Forschungsartikel

2022

FISH—in Plant ChromosomesHeitkam, T., Breitenbach, S. & Liedtke, S., 5 Okt. 2022, Cytogenetics and Molecular Cytogenetics. S. 339-352, 14 S.Elektronische (Volltext-)VersionPublikation: Beitrag in Buch/Konferenzbericht/Sammelband/Gutachten > Beitrag in Buch/Sammelband/Gutachten