19.11.2019
Neue Veröffentlichung in PLoS Computational Biology
Dr. Seifert hat einen neuen Artikel zum Thema „Network-based analysis of prostate cancer cell lines reveals novel marker gene candidates associated with radioresistance and patient relapse“ in der Fachzeitschrift PLoS Computational Biology veröffentlicht. Die Studie wurde in enger Zusammenarbeit mit dem Labor von Anna Dubrovska am OncoRay durchgeführt.
Wir haben einen netzwerkbasierten Ansatz entwickelt, der die Analyse von radioresistenten Prostatakrebs-Zelllinien ermöglicht, um klinisch relevante Markergene zu identifizieren, die mit Strahlenresistenz bei Prostatakrebspatienten assoziiert sind. Auf Basis dieses Ansatzes konnten 14 Kandidatengene identifiziert werden, deren Expressionsverhalten mit einem frühen oder späten Rückfall bei bestrahlten Prostatakrebspatienten assoziiert waren. Für ein ausgewähltes Kandidatengen konnten wir durch Validierungsexperimente zeigen, dass Expressionsveränderungen dieses Gens die Strahlenempfindlichkeit in Zellkulturmodellen beeinflusst.
Link zur Publikation: https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1007460