GENOFRA - Genotypisierung für die Erdbeerzüchtung (Fragaria ×ananassa)
Entwicklung eines hochauflösenden Genotypisierungsverfahrens für die Bereitstellung und effiziente Nutzung der genetischen Ressourcen in der Erdbeerzüchtung (Fragaria ×ananassa) (GENOFRA)
Die Kulturerdbeere wird zwar erst seit rund 250 Jahren züchterisch bearbeitet, zeigt aber bereits heute eine erhebliche und zunehmende Verarmung im Spektrum wichtiger Eigenschaften infolge negativer Domestikationseffekte. Für die Erfassung der originären genetischen Ressourcen der Kulturerdbeere werden deren alleinige Kreuzungseltern (F. chiloensis und F. virginiana) hochdicht genotypisiert. Durch den Vergleich mit den Genotypisierungsdaten von 185 Kulturen aus der Erdbeer-Sorten-Genbank werden die genetische Vielfalt und die auftretenden allelischen Variationen dargestellt. Diese Daten werden zur Bestimmung von Allelen bzw. Allelkombinationen für die markergestützte Selektion von züchterisch relevanten Leistungsparametern verwendet. Für die hochdichte Genotypisierung wird ein Genotyping by Sequencing-Verfahren entwickelt, bei dem die nicht informative und nicht-repetitive Genom-Fraktion im Vorfeld der Analysen ausgeschlossen wird. Damit verringert sich der Aufwand für die Proben- und bioinformatische Bearbeitung deutlich.
Kontakt:
Prof. Dr. Stefan Wanke E-Mail
Kooperationspartner:
Hansabred GmbH & Co. KG Startseite
ASGEN GmbH & Co. KG