Phylogenomik und Evolution der Pflanzen
Die pflanzliche Vielfalt und die Gründe für großen Artenreichtum mancher Entwicklungslinien zu verstehen ist eine der drängendsten Fragen innerhalb der integrativen Taxonomie und Evolutionsbiologie der Pflanzen. Für eine zukunftsfähige Form der Erfassung und Katalogisierung von Arten, müssen Taxonomics-Ansätze entwickelt werden, die im besten Fall universell auf unterschiedlichste Gruppen anwendbar sind. Unser Ziel ist es, eine solche Strategie, von uns als Plant Anchored MetaPrep (PAMP) bezeichnet, an mehreren der artenreichsten Pflanzenlinien zu testen. PAMP wurde für große Verbundvorhaben entwickelt, um die Forschungsansätze weltweit über Institutionen und Sammlungen hinweg zu vereinheitlichen. Das Skalierungspotenzial von PAMP wächst, wenn eine hohe Probenzahl erforderlich ist, wie z.B. in megadiversen neotropischen Gruppen. Anhand einer Vielzahl von Markern, die für hunderte Arten gleichzeitig verwendbar sind, werden wir repräsentativ megadiverse Gruppen aus den Magnoliiden, Monokotylen, Superasteriden und Superrosiden untersuchen. Im Rahmen von Vorarbeiten haben wir das universelle Markerset, wie auch das PAMP-Protokoll an mehreren Angiospermenlinien erfolgreich getestet. Neben den geplanten Taxon-spezifischen Fragestellungen, hat diese Forschung das Potenzial, Verbundprojekte zwischen diversen Institutionen und Sammlungen weltweit zu initiieren. Sie wird als solches erheblichen Einfluss auf die Wissenschaftsgemeinschaft und die naturwissenschaftlichen Sammlungen haben. Die Vision ist, für jeden Beleg einer Sammlung auch einen umfangreichen genomischen Datensatz bereitzustellen.
Kontakt:
Prof. Dr. Stefan Wanke E-Mail
Dr. Julia Naumann E-Mail
MSc Matthias Jost E-Mail
BSc Jakob Wegener E-Mail
Kooperationspartner:
Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM, Mexiko) (Prof. Dr. Susana Magallón, Prof. Dr. Gerardo A. Salazar, Prof. Dr. Carolina Granados, und andere…
Alan R. Lemmon und Emily Moriarty Lemmon (Florida State University, USA)
Ausgewählte Publikationen:
Müller S, Salomo K, Salazar J, Naumann J, Jaramillo MA, Neinhuis C, Feild TS, and Wanke S (2015) Intercontinental long-distance dispersal of Canellaceae from the New to the Old World revealed by a nuclear single copy gene and chloroplast loci. Phylogenetics and Evolution 84 (2015) 205–219.
Wanke S., Granados Mendoza C., Müller S., Paizanni Guillén A., Neinhuis C., Lemmon A.R., Lemmon E.M., Samain M.-S. (2017) Recalcitrant deep and shallow nodes in Aristolochia (Aristolochiaceae) illuminated using anchored hybrid enrichment. Molecular Phylogenetics and Evolution, http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2017.05.014
Buddenhagen C., Lemmon A. R., Moriarty Lemmon E., Bruhl J., Cappa J., Clement W L., Donoghue M., Edwards E. J., Hipp A. L., Kortyna M., Mitchell N., Moore A., Prychid C. J., Segovia-Salcedo M. C., Simmons M. P., Soltis P. S., Wanke S., Mast A. (2016) Anchored Phylogenomics of Angiosperms I: Assessing the Robustness of Phylogenetic Estimates, http://dx.doi.org/10.1101/086298