ER-flow – Building an European Research Community through Interoperable Workflows and Data

Mit ER-flow wird eine europäische Forschungs-Community aufgebaut, die den Austausch von Workflows und die Untersuchung von Interoperabilität von wissenschaftlichen Daten im Workflow-Bereich vorantreibt. Das Projekt baut auf die Erfolge des FP7-Projektes SHIWA auf; insbesondere auf die grobkörnige Workflow-Interoperabilität der SHIWA-Simulationsplattform. Es zielt auf wichtige Forschungsgebiete ab, die bereits Workflows für ihre regulären Experimente verwenden. Im Projektkonsortium sind deshalb die Wissenschaftsbereiche Astrophysik, Computation Chemistry, Heliophysik und Lebenswissenschaften vertreten, die dabei unterstützt werden, ihre Experimente auf der Simulationsplattform laufen zu lassen. Darüber hinaus wird das Projekt eng mit nationalen Grid Infrastrukturen wie NGI-DE in Deutschland zusammenarbeiten, um weitere Forschungscommunities zu identifizieren und zu involvieren, in denen bereits Workflows genutzt werden bzw., in denen Bedarf besteht. Um die Entwicklung, Verwendung und den Austausch von Worklfows zu demonstrieren, werden Pilot-Workflows für spezifische Anwendungsfälle genutzt, die im Rahmen von ER-flow auf die Simulationsplattform portiert und im Worklow-Repositorium veröffentlicht werden. Dabei geht es einerseits darum, zu demonstrieren wie die Simulationsplattform zu nutzen ist, zum anderen können Forscher die Workflows für ihre Experimente zu nutzen, wobei es möglich sein wird, die vorhandenen Workflows zu modifizieren, um neue zu erstellen. Die Pilot-Workflows werden helfen eine kritische Masse an Workflows zu erreichen um den Workflow-Austausch in und zwischen Communitys zu ermöglichen. Das Projekt wird Anforderungen der Communitys in Bezug auf die Interoperabilität wissenschaftlicher Daten im Workflow-Bereich sammeln und analysieren. Es wird existierende Protokolle und Standards untersuchen. Als Ergebnis soll eine Studie erstellt werden, die die oben genannten Anforderungen, Protokolle und Standards zusammenfasst und Empfehlungen für die Interoperabilität wissenschaftlicher Daten im Workflow-Bereich durch zukünftige Forschung, Entwicklung und Standardisierung gibt.

Partner

University of Westminster, United Kingdom
Magyar Tudomanyos Akademia Szamitastechnikai es Automatizalasi Kutato Intezete, Hungary
Centre National de la Recherche Scientifique, France
Stichting European Grid Initiative (EGI.eu), The Netherlands
Academic Medical Center of the University of Amsterdam, The Netherlands
Ludwig-Maximilians-Universität München, Germany
University College London, United Kingdom
Trinity College Dublin, Ireland
Istituto Nazionale di Astrofisica, Italy

Projektwebseite

http://www.erflow.eu/

Laufzeit

09/2012 - 08/2014

Förderung

EU/FP7

Publikationen

Richard Grunzke, Sandra Gesing, René Jäkel and Wolfgang E Nagel: Towards Generic Metadata Management in Distributed Science Gateway Infrastructures, 14th IEEE/ACM International Symposium on Cluster, Cloud and Grid Computing (IEEE/ACM CCGrid 2014), (accepted for publication).
Richard Grunzke, Jens Krüger, Sandra Gesing, Sonja Herres-Pawlis, Alexander Hoffmann and Luis de la Garza: Improved Resilience and Usability for Science Gateway Infrastructures via Integrated Virtual Organizations, EGI Community Forum 2014, (accepted for publication).
Sonja Herres-Pawlis, Alexander Hoffmann, Luis de la Garza, Jens Krüger, Sandra Gesing, Ákos Balaskó, Peter Kacsuk, Georg Birkenheuer, Richard Grunzke, Gabor Terstyansky, Noam Weingarten and Andre Brinkmann: Quantum chemical metaworkflows in MoSGrid, Concurrency and Computation: Practice and Experience, (accepted for publication).
Sonja Herres-Pawlis, Alexander Hoffmann, Richard Grunzke and Lars Packschies, Orbital analysis of oxo and peroxo dicopper complexes via quantum chemical workflows in MoSGrid, in: Proceedings of the International Workshop on Scientific Gateways 2013 (IWSG), 2013.
Richard Grunzke, Sebastian Breuers, Sandra Gesing, Sonja Herres-Pawlis, Martin Kruse, Dirk Blunk, Luis de la Garza, Lars Packschies, Patrick Schäfer, Charlotta Schärfe, Tobias Schlemmer, Thomas Steinke, Bernd Schuller, Ralph Müller-Pfefferkorn, René Jäkel, Wolfgang E. Nagel, Malcolm Atkinson and Jens Krüger, Standards-based Metadata Management for Molecular Simulations (2013), in: Concurrency and Computation: Practice and Experience, 2013.
Lars Packschies, Georg Birkenheuer, Dirk Blunk, Sebastian Breuers, Andre Brinkmann, Luis de la Garza, Ines Dos Santos Vieira, Gregor Fels, Sandra Gesing, Richard Grunzke, Sonja Herres-Pawlis, Oliver Kohlbacher, Jens Krüger, Martin Kruse, Ulrich Lang, Ralph Müller-Pfefferkorn, Patrick Schäfer, Tobias Schlemmer, Charlotta Schärfe, Thomas Steinke, Klaus-Dieter Warzecha and Andreas Zink, The MoSGrid-e-Science Gateway: Molecular Simulations in a Distributed Computing Environment (2013), in: Journal of Cheminformatics, 5(Suppl 1):03
Sonja Herres-Pawlis, Ákos Balaskó, Georg Birkenheuer, Andre Brinkmann, Sandra Gesing, Richard Grunzke, Alexander Hoffmann, Peter Kacsuk, Jens Krüger, Lars Packschies, Gabor Terstyansky and Noam Weingarten, User-friendly workflows in quantum chemistry, in: Proceedings of the International Workshop on Scientific Gateways 2013 (IWSG), 2013.