Illumina Stratamap: Großflächige, hochempfindli­che Spatial Profiling des gesamten Transkriptoms

Das DRESDEN-concept Genome Center (DcGC) hat in Zusammenarbeit mit den Histologie und Lichtmikroskopie Einrichtungen der CMCB-Technologieplattform Illumina StrataMap für die Spatial Transcriptomics implementiert. Die Technologie wurde kürzlich am DcGC eingeführt, und derzeit werden erste experimentelle Ergebnisse ausgewertet, um ihre Leistungsfähigkeit bei großflächigen, hochauflösenden Spatial-Transcriptomics-Analysen zu beurteilen. Als artspezifischer Ansatz lässt sich StrataMap auf verschiedene Gewebe und Modellorganismen anwenden.

StrataMap bietet eine Erfassungsfläche von bis zu 750 mm² und ermöglicht so die Analyse großer Gewebeschnitte oder mehrerer Proben in einem einzigen Experiment. Die Technologie nutzt eine auf Poly(A) basierende Erfassung für eine unverzerrte Ganztranskriptom-Profilierung ohne vordefinierte Sondenpanels, einschließlich des Nachweises von kodierenden und nicht-kodierenden Transkripten. Die mit Oligonukleotiden beschichtete Erfassungsfläche von 1 µm ermöglicht eine hohe spatial Auflösung und hohe Empfindlichkeit, wobei pro 10-µm-Intervall etwa 2.000 Transkripte nachgewiesen werden.

Interessiert? Bitte wenden Sie sich an DcGC, um OpenST für Ihr Projekt zu besprechen: