Modellierung der Dynamik der Rekonstitution des Blutes nach Stammzelltransplantation mithilfe einer neutralen Barcode-Markierung für hochauflösende Zellverfolgung
Unser Projekt zielt darauf ab, die hämatopoetische Rekonstitutionsdynamik nach HSC-Transplantation zu modellieren, indem wir hochauflösendes Barcode-Tracking mit der Analyse von Vektor-Integrationsstellen (VIS) kombinieren. Aufbauend auf einem bewährten Barcode-System und entsprechenden bioinformatischen Auswerte-pipelines wird unser Team Referenz-„Mini-Bulks“ generieren, molekulare Identifikatoren (UMIs) integrieren und die barcode-basierte Quantifizierung mit bestehenden VIS-Methoden vergleichen. Unter Verwendung eines Fanconi-Anämie-Mausmodells werden wir untersuchen, wie unterschiedliche Konditionierungsregime, Transplantatzusammensetzungen und Stressbedingungen die klonale Konkurrenz zwischen korrigierten und nicht korrigierten hämatopoetischen Stammzellen beeinflussen. Diese Arbeiten werden durch komplementäre mathematische Modellierung der klonalen Dynamik unterstützt.
Beteiligte Wissenschaftler:innen
- Prof. Dr. Ingmar Glauche
- Dipl.-Inf. Lars Thielecke
Partner
- PD Dr. Kerstin Cornils, UKE Hamburg
Finanzierung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)