GHGA - The German Human Genome-Phenome Archive
Next-generation sequencing (NGS) hat die biomedizinische Forschung revolutioniert und es Wissenschaftlern ermöglicht, mehr Einblicke in den zugrunde liegenden genetischen Mechanismus verschiedener Krankheiten zu gewinnen. In der Folge haben diese wissenschaftlichen Errungenschaften zu einer verbesserten Diagnostik und Arzneimittelentwicklung geführt, die Patienten dabei unterstützt, die bestmöglichen Therapien zu erhalten. Dabei sind eine groß angelegte Sammlung und der Austausch archivierter Daten mit der wissenschaftlichen Gemeinschaft Schlüsselfaktoren, um die bestmögliche Wirkung in der medizinischen Forschung zu gewährleisten. Das Deutsche Human-Genom-Phänomen-Archiv (German Human Genome-Phenome Archive-GHGA) wird von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) gefördert und hat das Ziel, eine nationale Infrastruktur für die sichere Speicherung, Analyse und den Austausch von humanen Omics-Daten bereitzustellen und dabei zu gewährleisten, dass die gesetzlichen Richtlinien in Deutschland eingehalten werden. Hierfür wird GHGA Daten Hubs in sechs NGS-Kompetenzzentren in ganz Deutschland betreiben und international in europäische Infrastrukturen eingebettet sein, indem es zu einem nationalen Knotenpunkt des European Genome Archive (EGA) wird.
Zusammen mit dem DRESDEN-concept Genome Center (DcGC) wird das Zentrum für Informationsdienste und Hochleistungsrechnen (ZIH) der TU Dresden eines der sechs Data Hubs innerhalb des nationalen GHGA-Netzwerks bilden. Hierfür stellt das ZIH die HPC-, Cloud- und Speicherkapazität zur Verfügung, die notwendig sind, um die GHGA-Infrastruktur zu nutzen und generierte menschliche Datensätze angemessen zu archivieren. Weiterhin wird es eine dedizierte ETL-Pipeline entwickeln und betreiben, um eine beschleunigte Übertragung von Daten und Metadaten vom Genomzentrum zum endgültigen Speicherort zu gewährleisten. Zusätzlich wird es Wissenschaftler des DcGC bei der Ausführung ihrer NGS-Pipelines mit High Performance Computing unterstützen, um die Sicherheit und Leistung ihrer Workflow-Ausführung sicherzustellen.
Projektwebseite
Partner
ZIH-Kontakt
Laufzeit
10/2020-09/2025
Förderung
Das GHGA-Konsortium und seine Partner werden von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) im Rahmen der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) gefördert.