HPC-Systeme

Das ZIH betreibt aktuell einen Hochleistungsrechner mit mehr als 60.000 Kernen, 448 GPUs sowie einer flexiblen Speicherhierarchie mit ca. 16 PB Speicherplatz. Er bietet insbesondere im Bereich Data Analytics und maschinelles Lernen und für die Verarbeitung besonders großer Datensätze ein optimales Forschungsumfeld, ist aber ebenso für hochskalierbare, daten- und rechenintensive Anwendungen sehr gut geeignet.
Durch gemeinsame Login-Knoten und Dateisysteme können Nutzer:innen leicht zwischen den auf verschiedene Aufgaben spezialisierten Teilkomponenten wechseln. Vorinstallierte Software-Umgebungen ermöglichen einen schnellen Start. Um Zugang zu unseren HPC-Ressourcen zu erhalten, ist ein kurzer Projektantrag nötig.

Inhaltsverzeichnis

1. 1. Für daten- und rechenintensive HPC-Anwendungen
   2. Für HPC Data Analytics und maschinelles Lernen
   3. Für die Verarbeitung besonders großer Datensätze

Für daten- und rechenintensive HPC-Anwendungen

Der Hochleistungsrechner-/Speicherkomplex (HRSK-II) der Firma Bull/Atos stellt den größten Teil der am ZIH verfügbaren Rechenleistung bereit, insbesondere für hochparallele, daten- und rechenintensive HPC-Anwendungen.
Typische Anwendungen: FEM-Simulationen, CFD-Rechnungen mit Ansys oder OpenFOAM, Molekulardynamik mit GROMACS oder NAMD, Berechnungen mit Matlab oder R

• ca. 40.000 Prozessorkerne (Intel Haswell und Broadwell)
• Speicherausstattung: typisch 2.6 GB/Kern, bis zu 36 GB/Kern
• 256 GPUs (Nvidia K80)
• Dokumentation
   

Für HPC Data Analytics und maschinelles Lernen

Die Erweiterung High Performance Computing – Data Analytics (HPC-DA) steht Nutzer:innen aus ganz Deutschland zur Verfügung. Durch seine Flexibilität können die verschiedene Technologien von HPC-DA zu individuellen und effizienten Forschungsinfrastrukturen kombiniert werden. Speziell für Anwendungen im Bereich Machine Learning und Deep Learning sind 192 leistungsfähige Nvidia V100 GPUs installiert. Dafür können Ressourcen auch interaktiv, z.B. in Form von Jupyter-Notebooks genutzt werden. Für Datenanalysen auf CPUs steht ein Cluster mit hoher Speicherbandbreite zur Verfügung. Zum effizienten Zugriff auf große Datensätze werden 2 Petabyte Flash-Speicher mit einer Gesamtbandbreite von etwa 2 Terabyte/s bereitgestellt.
Typische Anwendungen: Training neuronaler Netze mit Tensorflow (Deep Learning), Datenanalysen mit Big-Data-Frameworks wie Apache Spark

• 32 IBM Power 9 Knoten, je 6 Nvidia V100 GPUs für maschinelles Lernen
• 192 AMD Rome Knoten, je 128 Kerne, 512 GB RAM mit 400 GB/s Bandbreite
• 2 PB schneller Flash-Speicher (NVMe)
• 10 PB Archiv mit Zugriff per S3, Cinder, NFS, QXFS

• Dokumentation

   

Für die Verarbeitung besonders großer Datensätze

Das Shared-Memory-System HPE Superdome Flex ist für besonders datenintensive Anwendungsfälle geeignet, z.B. um sehr große Datensätze komplett im Hauptspeicher oder im sehr schnell zugreifbaren NVMe-Speicher verarbeiten zu können. Als Teil von HPC-DA steht es ebenfalls Nutzer:innen aus ganz Deutschland zur Verfügung.
Typische Anwendungen: Anwendungen, welche einen großen gemeinsam Hauptspeicher voraussetzen, wie z.B. Genomanalyse

• Shared-Memory-Verbund aus 32 Intel CascadeLake mit zusammen 896 Kernen
• 48 TB Hauptspeicher in einem gemeinsamen Adressraum
• 400 TB NVMe-Speicherkarten als sehr schneller, lokaler Storage
• Dokumentation